2012-12-01から1ヶ月間の記事一覧

Perl でawkライクなワンライナー(GFFからの行抽出など)

メモ.awkでいいという噂もありますが… window.twttr = (function(d, s, id) { var js, fjs = d.getElementsByTagName(s)[0], t = window.twttr || {}; if (d.getElementById(id)) return t; js = d.createElement(s); js.id = id; js.src = "https://platfo…

RStudioでknit HTMLで図が出力されなかったのを解決した

R

いつの間にか,RStudioの knit HTMLボタンで作ったHTMLに図が出力されなくなったので(問題の分析が出来てないまま@wakutekaに相談したり…すみません…)色々試したり調べたりしていました. こちらの掲示板で,knitrはevaluateに依存しているけど,そのevalu…

Bowtie2でmultiple hitの扱いがおかしい件(Tophat,Cufflinksとの関連で)

gaou_akさんのツイートで知りました. window.twttr = (function(d, s, id) { var js, fjs = d.getElementsByTagName(s)[0], t = window.twttr || {}; if (d.getElementById(id)) return t; js = d.createElement(s); js.id = id; js.src = "https://platfor…

確率変数としてのp-valueの感覚をRで身につける

R Advent Calendar 2012の7日目です.もう一週間経ったのですね. The American Statistician, August 2008, Vol. 62, No. 3 P-Values are Random Variables (PDF) で「学生がp-valueについて理解するためにはp-valueが確率変数であることを強調した方がいい…

BAMヘッダーのサイズが大きいとCufflinksでエラーが出る

window.twttr = (function(d, s, id) { var js, fjs = d.getElementsByTagName(s)[0], t = window.twttr || {}; if (d.getElementById(id)) return t; js = d.createElement(s); js.id = id; js.src = "https://platform.twitter.com/widgets.js"; fjs.paren…