先日、後輩から「UCSCからダウンロードした遺伝子の座標から塩基配列を取得するときに、ファイルに書かれた座標とゲノムブラウザでみた配列が1つずれてる」と言われました。 自分もかつて同じ問題にぶつかったのですが、意外と知らない人がいると思い、まと…

あんまり需要はない知識ですが、SAMファイルをSAMToolsなどを使わずに直接いじくったときに引っかかったことをメモ。The SAM Format Specification (v1.4-r962)(pdf) multiread(複数の箇所にマップされたリード)を除きたい場合 あるリードが複数の箇所にマッ…